基因不合在生物学上解释，就是某种基因搭配的个体无法存活或者生存能力低。后代在双亲那里获得等位基因，而一对等位基因控制某种性状，这种形状决定个体的生存能力，一些遗传疾病就是由于亲代的一方或者双方给后代提供了不良基因而导致。

基因中有显性和隐性之分，如果亲代的等位基因为一显一隐，隐性基因在亲代身上得不到体现，但如果两个亲代都把自己的隐性基因遗传给同一个后代，则该后代显示隐性基因的性状特征，如果这个隐性基因是某种遗传病的密码，则后代就是病体，这也就是为什么两个健康夫妻可能生下遗传病的后代。